生徒の自己実現・進路実現と地域社会に貢献できる人材の育成を目標に、芦原・金津両中学校の3年次に中高一貫クラスを設けています。金津高校では、このクラスから入学してきた生徒を中高一貫クラスとして編制しています。このような中高一貫の取組は、あわら市独自のものです。両中学校の中高一貫クラスでは、数学・英語科の教員が乗り入れ授業を行っています。
本校では、生徒の能力・適性および進路希望に応じたきめ細かな学習指導を行っています。
進学指導については、国公立大学から専修学校まで、生徒それぞれの志望に対応できる学習指導を実施し、指導教材の精選や指導方法の工夫・改善に努めています。また生徒の状況に応じた個別指導にも重点をおいており、成果をあげています。